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Três íons de sódio (Na+) presentes no citosol ligam-se a sítios específicos na ATPase. Na subunidade maior liga-se também o ATP que por fosforilação altera a conformação da proteína transportadora, liberando ADP e movimentando os íons Na+ para o meio externo. Dois íons de potássio (K+) presentes no meio extracelular ligam-se a sítios de alta afinidade na ATPase. A desfoforilação reduz a afinidade dos íons K+ e estes são liberados no citosol.

Formação do gradiente de prótons no espaço intermembranar da mitocôndria para síntese de ATP. O transporte de elétrons não está representado.